株取引やFXなどの損益は、仮想通貨取引の損益と通算することはできますか？

損益通算できません。

仮想通貨で得た所得は、他の所得と合算して課税額を計算する「総合課税」の対象です。

株取引やFXで得た所得は、単独で課税額を計算する「分離課税」が適用されますので、合算できません。